MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfomonile tiedjei DSM 6799 plasmid pDESTI.01

Total Repeats: 406

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018026	ACC	2	6	302	307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392413880
2	NC_018026	TGG	2	6	318	323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413880
3	NC_018026	CCGT	2	8	419	426	0 %	25 %	25 %	50 %	392413880
4	NC_018026	AAC	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392413880
5	NC_018026	CAA	2	6	502	507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392413880
6	NC_018026	TG	4	8	538	545	0 %	50 %	50 %	0 %	392413880
7	NC_018026	GTC	2	6	591	596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413880
8	NC_018026	A	6	6	1992	1997	100 %	0 %	0 %	0 %	392413881
9	NC_018026	GAAA	2	8	2002	2009	75 %	0 %	25 %	0 %	392413881
10	NC_018026	TGG	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413881
11	NC_018026	ATC	2	6	2092	2097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392413881
12	NC_018026	GGC	2	6	2101	2106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413881
13	NC_018026	AAG	2	6	2146	2151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413881
14	NC_018026	CGA	2	6	2229	2234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413882
15	NC_018026	GTA	2	6	2274	2279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392413882
16	NC_018026	GGC	2	6	2280	2285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413882
17	NC_018026	GTG	2	6	2361	2366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413882
18	NC_018026	AG	3	6	2428	2433	50 %	0 %	50 %	0 %	392413882
19	NC_018026	GCTG	2	8	2462	2469	0 %	25 %	50 %	25 %	392413882
20	NC_018026	CGG	2	6	2501	2506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413882
21	NC_018026	TC	3	6	2539	2544	0 %	50 %	0 %	50 %	392413882
22	NC_018026	GAG	2	6	2561	2566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413882
23	NC_018026	TGA	2	6	2720	2725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392413882
24	NC_018026	TCA	2	6	2800	2805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392413882
25	NC_018026	CGC	2	6	2825	2830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413882
26	NC_018026	CTT	2	6	3129	3134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392413883
27	NC_018026	AGCGGC	2	12	3228	3239	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	392413883
28	NC_018026	TAC	2	6	3241	3246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392413883
29	NC_018026	CTG	2	6	3306	3311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413883
30	NC_018026	TTC	2	6	3334	3339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392413883
31	NC_018026	GGA	2	6	3435	3440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413883
32	NC_018026	AAG	2	6	3550	3555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413883
33	NC_018026	TGC	2	6	3683	3688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413883
34	NC_018026	GAC	2	6	3696	3701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413883
35	NC_018026	CTT	2	6	3774	3779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392413883
36	NC_018026	AGA	2	6	3877	3882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413884
37	NC_018026	TGC	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413884
38	NC_018026	TGC	2	6	4127	4132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413884
39	NC_018026	TGCT	2	8	4178	4185	0 %	50 %	25 %	25 %	392413885
40	NC_018026	CAT	2	6	4218	4223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392413885
41	NC_018026	TA	3	6	4233	4238	50 %	50 %	0 %	0 %	392413885
42	NC_018026	GAA	2	6	4267	4272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413885
43	NC_018026	CAGC	2	8	4699	4706	25 %	0 %	25 %	50 %	392413886
44	NC_018026	GAT	2	6	4729	4734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392413886
45	NC_018026	TTG	3	9	4824	4832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392413886
46	NC_018026	TCCA	2	8	4840	4847	25 %	25 %	0 %	50 %	392413886
47	NC_018026	TCAT	2	8	4872	4879	25 %	50 %	0 %	25 %	392413886
48	NC_018026	TGA	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392413886
49	NC_018026	GTT	2	6	4983	4988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392413886
50	NC_018026	CTT	2	6	5011	5016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392413886
51	NC_018026	T	6	6	5025	5030	0 %	100 %	0 %	0 %	392413886
52	NC_018026	TGA	2	6	5032	5037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392413886
53	NC_018026	CAGCC	2	10	5041	5050	20 %	0 %	20 %	60 %	392413886
54	NC_018026	CCA	2	6	5095	5100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392413886
55	NC_018026	CGC	2	6	5151	5156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413886
56	NC_018026	TC	4	8	5324	5331	0 %	50 %	0 %	50 %	392413887
57	NC_018026	CTC	3	9	5329	5337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392413887
58	NC_018026	TTCT	2	8	5449	5456	0 %	75 %	0 %	25 %	392413887
59	NC_018026	CAG	2	6	5578	5583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413887
60	NC_018026	CTC	2	6	5615	5620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392413887
61	NC_018026	TGC	2	6	5629	5634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413887
62	NC_018026	TCC	2	6	5641	5646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392413887
63	NC_018026	CCG	2	6	5701	5706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413887
64	NC_018026	GAA	2	6	5802	5807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413887
65	NC_018026	A	6	6	5806	5811	100 %	0 %	0 %	0 %	392413887
66	NC_018026	TTC	2	6	5827	5832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392413887
67	NC_018026	ACG	2	6	5839	5844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413887
68	NC_018026	CAG	2	6	6055	6060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413887
69	NC_018026	AGG	2	6	6125	6130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413887
70	NC_018026	TCC	2	6	6157	6162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392413888
71	NC_018026	ACC	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392413888
72	NC_018026	CGT	2	6	6287	6292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413888
73	NC_018026	TGC	2	6	6339	6344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413888
74	NC_018026	GAA	2	6	6396	6401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413888
75	NC_018026	TTC	2	6	6429	6434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392413888
76	NC_018026	TCC	3	9	6438	6446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392413888
77	NC_018026	GTTC	2	8	6478	6485	0 %	50 %	25 %	25 %	392413888
78	NC_018026	CTC	2	6	6512	6517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392413888
79	NC_018026	CAG	2	6	6521	6526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413888
80	NC_018026	GAA	2	6	6537	6542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413888
81	NC_018026	CTC	2	6	6581	6586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392413888
82	NC_018026	GACT	2	8	6654	6661	25 %	25 %	25 %	25 %	392413888
83	NC_018026	TG	3	6	6687	6692	0 %	50 %	50 %	0 %	392413888
84	NC_018026	CAGCA	2	10	6699	6708	40 %	0 %	20 %	40 %	392413888
85	NC_018026	CCAG	2	8	6724	6731	25 %	0 %	25 %	50 %	392413888
86	NC_018026	TGG	2	6	6829	6834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413888
87	NC_018026	AAGG	2	8	6882	6889	50 %	0 %	50 %	0 %	392413888
88	NC_018026	GAA	2	6	6927	6932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413888
89	NC_018026	ATC	2	6	7173	7178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392413889
90	NC_018026	TC	3	6	7227	7232	0 %	50 %	0 %	50 %	392413889
91	NC_018026	GAA	2	6	7256	7261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413889
92	NC_018026	AAC	2	6	7330	7335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392413889
93	NC_018026	GGA	2	6	7517	7522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413889
94	NC_018026	CGC	2	6	7546	7551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413889
95	NC_018026	TCT	2	6	7568	7573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392413889
96	NC_018026	ATA	2	6	7584	7589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392413889
97	NC_018026	TCA	2	6	7600	7605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392413889
98	NC_018026	GGAC	2	8	7734	7741	25 %	0 %	50 %	25 %	392413889
99	NC_018026	TAT	2	6	7754	7759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392413889
100	NC_018026	TGA	2	6	7784	7789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392413889
101	NC_018026	GAT	2	6	7869	7874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392413889
102	NC_018026	GAG	2	6	7914	7919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413889
103	NC_018026	CTG	2	6	7920	7925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413889
104	NC_018026	TCC	2	6	7938	7943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392413889
105	NC_018026	AAC	2	6	7944	7949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392413889
106	NC_018026	AAG	2	6	8003	8008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413890
107	NC_018026	TCC	2	6	8114	8119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392413890
108	NC_018026	TCCAA	2	10	8148	8157	40 %	20 %	0 %	40 %	392413890
109	NC_018026	TGG	2	6	8214	8219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413890
110	NC_018026	CCG	2	6	8313	8318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413890
111	NC_018026	GAA	2	6	8344	8349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413890
112	NC_018026	AGCA	2	8	8371	8378	50 %	0 %	25 %	25 %	392413890
113	NC_018026	G	6	6	8382	8387	0 %	0 %	100 %	0 %	392413890
114	NC_018026	ACC	2	6	8413	8418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392413890
115	NC_018026	TCC	2	6	8992	8997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392413891
116	NC_018026	CTC	2	6	9006	9011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392413891
117	NC_018026	CTG	2	6	9035	9040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413891
118	NC_018026	AAG	2	6	9049	9054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413891
119	NC_018026	TCG	2	6	9081	9086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413891
120	NC_018026	CCCGG	2	10	9142	9151	0 %	0 %	40 %	60 %	392413891
121	NC_018026	ACT	2	6	9160	9165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392413891
122	NC_018026	AGAAA	2	10	9245	9254	80 %	0 %	20 %	0 %	392413891
123	NC_018026	A	6	6	9259	9264	100 %	0 %	0 %	0 %	392413891
124	NC_018026	AAC	2	6	9307	9312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392413891
125	NC_018026	TCCC	3	12	9313	9324	0 %	25 %	0 %	75 %	392413891
126	NC_018026	C	6	6	9322	9327	0 %	0 %	0 %	100 %	392413891
127	NC_018026	AACA	2	8	9388	9395	75 %	0 %	0 %	25 %	392413891
128	NC_018026	CGT	2	6	9434	9439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413891
129	NC_018026	ATC	2	6	9461	9466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392413891
130	NC_018026	CTC	2	6	9475	9480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392413891
131	NC_018026	GAA	2	6	9528	9533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413891
132	NC_018026	TTCCA	2	10	9546	9555	20 %	40 %	0 %	40 %	392413891
133	NC_018026	CAT	2	6	9572	9577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392413891
134	NC_018026	GAA	2	6	9591	9596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413891
135	NC_018026	GCT	2	6	9606	9611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413891
136	NC_018026	CT	3	6	9610	9615	0 %	50 %	0 %	50 %	392413891
137	NC_018026	GA	3	6	9625	9630	50 %	0 %	50 %	0 %	392413891
138	NC_018026	CGG	2	6	9656	9661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413891
139	NC_018026	GGC	2	6	9692	9697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413891
140	NC_018026	AGA	2	6	9710	9715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413891
141	NC_018026	CCAA	2	8	9722	9729	50 %	0 %	0 %	50 %	392413891
142	NC_018026	CATC	2	8	9735	9742	25 %	25 %	0 %	50 %	392413891
143	NC_018026	CCGTC	2	10	9767	9776	0 %	20 %	20 %	60 %	392413891
144	NC_018026	CAGGC	2	10	9823	9832	20 %	0 %	40 %	40 %	392413891
145	NC_018026	CCT	2	6	9843	9848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392413891
146	NC_018026	GCCTGA	2	12	9851	9862	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392413891
147	NC_018026	TCA	2	6	9883	9888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392413891
148	NC_018026	GAT	2	6	10001	10006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392413891
149	NC_018026	CGA	2	6	10238	10243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413892
150	NC_018026	AAG	2	6	10291	10296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413892
151	NC_018026	TCA	2	6	10417	10422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392413892
152	NC_018026	GCA	2	6	10424	10429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413892
153	NC_018026	A	6	6	10497	10502	100 %	0 %	0 %	0 %	392413892
154	NC_018026	TGCC	2	8	10535	10542	0 %	25 %	25 %	50 %	392413892
155	NC_018026	AGC	2	6	10569	10574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413892
156	NC_018026	CTT	2	6	10604	10609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392413892
157	NC_018026	GGA	2	6	10629	10634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413892
158	NC_018026	GAAA	2	8	10656	10663	75 %	0 %	25 %	0 %	392413892
159	NC_018026	CGG	2	6	10678	10683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413892
160	NC_018026	TGT	2	6	10694	10699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392413892
161	NC_018026	GGA	2	6	10712	10717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413892
162	NC_018026	ACG	2	6	10744	10749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413892
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164	NC_018026	GCTG	2	8	10808	10815	0 %	25 %	50 %	25 %	392413892
165	NC_018026	AAG	2	6	10866	10871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413892
166	NC_018026	TTG	2	6	10894	10899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392413892
167	NC_018026	AG	3	6	10917	10922	50 %	0 %	50 %	0 %	392413892
168	NC_018026	GATT	2	8	10934	10941	25 %	50 %	25 %	0 %	392413892
169	NC_018026	GTT	2	6	10955	10960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392413892
170	NC_018026	GAC	2	6	10971	10976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413892
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174	NC_018026	TCA	2	6	11151	11156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392413893
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193	NC_018026	GGA	2	6	12334	12339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413893
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241	NC_018026	TGCC	2	8	15073	15080	0 %	25 %	25 %	50 %	392413895
242	NC_018026	GCC	3	9	15083	15091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413895
243	NC_018026	GAGG	2	8	15239	15246	25 %	0 %	75 %	0 %	392413895
244	NC_018026	GCA	2	6	15359	15364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413895
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246	NC_018026	TCCA	3	12	15472	15483	25 %	25 %	0 %	50 %	392413895
247	NC_018026	CGG	2	6	15514	15519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413895
248	NC_018026	GGCT	2	8	15586	15593	0 %	25 %	50 %	25 %	392413895
249	NC_018026	TGG	2	6	15912	15917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413896
250	NC_018026	ACCC	2	8	16070	16077	25 %	0 %	0 %	75 %	392413896
251	NC_018026	TC	3	6	16087	16092	0 %	50 %	0 %	50 %	392413896
252	NC_018026	CTT	2	6	16177	16182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392413896
253	NC_018026	GGA	2	6	16205	16210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413896
254	NC_018026	TTG	2	6	16266	16271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392413896
255	NC_018026	CTCAC	2	10	16436	16445	20 %	20 %	0 %	60 %	392413897
256	NC_018026	CTTCCT	2	12	16476	16487	0 %	50 %	0 %	50 %	392413897
257	NC_018026	CAATGG	2	12	16596	16607	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	392413897
258	NC_018026	GTC	2	6	16664	16669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413897
259	NC_018026	AT	3	6	16696	16701	50 %	50 %	0 %	0 %	392413897
260	NC_018026	TC	3	6	16778	16783	0 %	50 %	0 %	50 %	392413897
261	NC_018026	TGT	2	6	16845	16850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392413897
262	NC_018026	GAA	2	6	16854	16859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413897
263	NC_018026	CTT	2	6	16933	16938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392413897
264	NC_018026	CCT	2	6	17034	17039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392413897
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267	NC_018026	AGA	2	6	17231	17236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413897
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270	NC_018026	AGGA	2	8	17512	17519	50 %	0 %	50 %	0 %	392413897
271	NC_018026	TAT	2	6	17703	17708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392413897
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389	NC_018026	CGG	2	6	25905	25910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413904
390	NC_018026	TCAA	2	8	25958	25965	50 %	25 %	0 %	25 %	392413904
391	NC_018026	CGG	2	6	25999	26004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413904
392	NC_018026	AAG	2	6	26014	26019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413904
393	NC_018026	TGG	2	6	26071	26076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413904
394	NC_018026	ACG	2	6	26103	26108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413904
395	NC_018026	AC	4	8	26118	26125	50 %	0 %	0 %	50 %	392413904
396	NC_018026	AC	3	6	26349	26354	50 %	0 %	0 %	50 %	392413904
397	NC_018026	GGCTGG	2	12	26369	26380	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	392413904
398	NC_018026	AAG	2	6	26449	26454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413904
399	NC_018026	AAG	2	6	26587	26592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413904
400	NC_018026	AG	3	6	26632	26637	50 %	0 %	50 %	0 %	392413904
401	NC_018026	CGC	2	6	26650	26655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413904
402	NC_018026	TGA	3	9	26783	26791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392413904
403	NC_018026	ACG	2	6	26795	26800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413904
404	NC_018026	ACG	2	6	26822	26827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413904
405	NC_018026	TCG	2	6	26849	26854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413904
406	NC_018026	ATG	2	6	26860	26865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392413904

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.